列車は大井川橋梁で大井川を越え金谷に到着します。建設当時は海岸沿いの相良や浜岡を通り牧之原台地を迂回するルートが計画されていましたが熱心な誘致運動により台地をトンネルで貫きトンネルに隣接するような形で金谷駅が設置されました。大井川鐵道の分岐駅ですが台地のすぐ近くにあるため隣の島田や菊川に比べるとかなり閑散としています。
平屋建てのコンクリート駅舎です。
奥に見えるのは大井川鐵道の金谷駅です。
駅舎内はキオスクなども無くだだっ広い印象です。
ホームは2面2線で中線と側線が１本ずつあります。ホームの移動は地下道を使います。奥にあるのは牧の原トンネルで駿河と遠江の境とも言われています。
牧の原トンネルの一番右端には廃止にされたトンネルの坑口が今も残っています。