信越本線の駅では長野県の北限にありかつては特急「あさま」も全列車が停車していました。信濃町の代表駅であり黒姫高原や野尻湖への玄関口でもあるため休日は観光客で賑わっています。
屋根が高い洋風の木造駅舎です。駅前からは野尻湖や黒姫高原に向かうバスが発着しています。
切符売り場。券売機は2台ありましたが1台撤去されていました。
改札口。従来の改札は使われておらず右端の出口のみが使われています。
黒姫駅構内の駅そば。国内でも有名な駅そばで移管前に閉店しましたが現在は営業を再開しています。
ホームは2面3線。
駅構内には転車台が残っています。
写真付き駅名標は黒姫高原。